O coronavírus 2 da síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV-2), o patógeno causador da mais recente pandemia de doença por coronavírus 2019 (COVID-19), é um vírus de RNA de fita simples de sentido positivo com um tamanho de genoma de cerca de 30 kb . Muitas variantes do SARS-CoV-2 com assinaturas mutacionais distintas surgiram durante a pandemia. Dependendo do cenário mutacional da proteína spike, algumas variantes mostraram maior transmissibilidade, infectividade e virulência.

A linhagem BA.2.86 do SARS-CoV-2, que foi identificada pela primeira vez em agosto de 2023, é filogeneticamente distinta das linhagens Omicron XBB atualmente em circulação, incluindo EG.5.1 e HK.3. A linhagem BA.2.86 contém mais de 30 mutações na proteína spike, indicando que esta linhagem é altamente capaz de escapar da imunidade anti-SARS-CoV-2 pré-existente.

O JN.1 (BA.2.86.1.1) é a variante emergente mais recentemente do SARS-CoV-2 que descende da linhagem BA.2.86. O JN.1 contém uma mutação característica L455S na proteína spike e três outras mutações nas proteínas não spike. Estudos que investigam o HK.3 e outras variantes “FLip” mostraram que a aquisição da mutação L455F na proteína spike está associada ao aumento da transmissibilidade viral e da capacidade de evasão imunológica. As mutações L455F e F456L são apelidadas de “Virar"mutações porque trocam as posições de dois aminoácidos, rotulados F e L, na proteína spike.

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