O coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (SARS-CoV-2), o patógeno causador da pandemia mais recente da doença do coronavírus de 2019 (COVID-19), é um vírus de RNA fita simples, de sentido positivo, com genoma de cerca de 30 kb. Muitas variantes do SARS-CoV-2 com assinaturas mutacionais distintas surgiram ao longo da pandemia. Dependendo do cenário mutacional da proteína spike, algumas variantes demonstraram maior transmissibilidade, infectividade e virulência.

A linhagem BA.2.86 do SARS-CoV-2, identificada pela primeira vez em agosto de 2023, é filogeneticamente distinta das linhagens Ômicron XBB atualmente em circulação, incluindo EG.5.1 e HK.3. A linhagem BA.2.86 contém mais de 30 mutações na proteína spike, indicando que essa linhagem é altamente capaz de escapar da imunidade anti-SARS-CoV-2 preexistente.

A JN.1 (BA.2.86.1.1) é a variante mais recente do SARS-CoV-2, descendente da linhagem BA.2.86. A JN.1 contém uma mutação característica, a L455S, na proteína spike e três outras mutações nas proteínas não spike. Estudos que investigam a HK.3 e outras variantes "FLip" demonstraram que a aquisição da mutação L455F na proteína spike está associada ao aumento da transmissibilidade viral e da capacidade de evasão imunológica. As mutações L455F e F456L são apelidadas de "Virar"mutações porque elas trocam as posições de dois aminoácidos, chamados F e L, na proteína spike.

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