मानवी एन्टरोव्हायरस 71 (EV71) पिकोर्नाविरिडे कुटुंबातील आहे. जीनोम सुमारे 7400 न्यूक्लियोटाइड्सची लांबी आणि फक्त एक ओपन रीडिंग फ्रेमसह सिंगल-स्ट्रँड पॉझिटिव्ह स्ट्रँडेड आरएनए आहे. एन्कोड केलेल्या पॉलीप्रोटीनमध्ये सुमारे 2190 अमीनो ऍसिड असतात. या पॉलीप्रोटीनचे पुढे P1, P2 आणि P3 पूर्ववर्ती प्रथिनांमध्ये हायड्रोलायझ केले जाऊ शकते. P1 पूर्ववर्ती प्रोटीन कोड स्ट्रक्चरल प्रोटीन VP1, VP2, VP3 आणि VP4; P2 आणि P3 कोड 7 नॉनस्ट्रक्चरल प्रोटीन (2A~2C आणि 3A~3D). या 4 स्ट्रक्चरल प्रोटीन्समध्ये, व्हीपी4 वगळता जे व्हायरल कॅप्सिडच्या आतील बाजूस एम्बेड केलेले असतात आणि कोरशी जवळून जोडलेले असतात, इतर 3 स्ट्रक्चरल प्रथिने विषाणूच्या कणांच्या पृष्ठभागावर उघडकीस येतात. अशा प्रकारे, प्रतिजैनिक निर्धारक मूलतः VP1~VP3 वर स्थित असतात.