ഹ്യൂമൻ എൻ്ററോവൈറസ് 71 (EV71) പിക്കോർണവിറിഡേ കുടുംബത്തിൽ പെട്ടതാണ്. ഏകദേശം 7400 ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകളുടെ നീളവും ഒരു ഓപ്പൺ റീഡിംഗ് ഫ്രെയിമും മാത്രമുള്ള സിംഗിൾ-സ്ട്രാൻഡഡ് പോസിറ്റീവ് സ്ട്രാൻഡഡ് ആർഎൻഎയാണ് ജീനോം. എൻകോഡ് ചെയ്ത പോളിപ്രോട്ടീനിൽ ഏകദേശം 2190 അമിനോ ആസിഡുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു. ഈ പോളിപ്രോട്ടീൻ P1, P2, P3 മുൻഗാമി പ്രോട്ടീനുകളിലേക്ക് ഹൈഡ്രോലൈസ് ചെയ്യാവുന്നതാണ്. P1 മുൻഗാമി പ്രോട്ടീൻ കോഡുകൾ ഘടനാപരമായ പ്രോട്ടീനുകൾ VP1, VP2, VP3, VP4; P2, P3 കോഡ് 7 നോൺസ്ട്രക്ചറൽ പ്രോട്ടീനുകൾ (2A~2C, 3A~3D). ഈ 4 ഘടനാപരമായ പ്രോട്ടീനുകളിൽ, വൈറൽ ക്യാപ്‌സിഡിൻ്റെ ആന്തരിക വശത്ത് ഉൾച്ചേർത്തതും കാമ്പുമായി അടുത്ത ബന്ധമുള്ളതുമായ VP4 ഒഴികെ, മറ്റ് 3 ഘടനാപരമായ പ്രോട്ടീനുകൾ എല്ലാം വൈറസ് കണങ്ങളുടെ ഉപരിതലത്തിൽ തുറന്നുകാട്ടപ്പെടുന്നു. അതിനാൽ, ആൻ്റിജനിക് ഡിറ്റർമിനൻ്റുകൾ അടിസ്ഥാനപരമായി VP1~VP3-ൽ സ്ഥിതി ചെയ്യുന്നു.