മനുഷ്യ എന്ററോവൈറസ് 71 (EV71) പിക്കോർണവൈറസ് കുടുംബത്തിൽ പെടുന്നു. ഏകദേശം 7400 ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകളുടെ നീളവും ഒരു തുറന്ന വായനാ ഫ്രെയിമും മാത്രമുള്ള ഒരു സിംഗിൾ-സ്ട്രാൻഡഡ് പോസിറ്റീവ് സ്ട്രാൻഡഡ് ആർ‌എൻ‌എയാണ് ഈ ജീനോം. എൻ‌കോഡ് ചെയ്ത പോളിപ്രോട്ടീനിൽ ഏകദേശം 2190 അമിനോ ആസിഡുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു. ഈ പോളിപ്രോട്ടീനിനെ പി 1, പി 2, പി 3 പ്രികർസർ പ്രോട്ടീനുകളിലേക്ക് കൂടുതൽ ഹൈഡ്രോലൈസ് ചെയ്യാൻ കഴിയും. പി 1 പ്രികർസർ പ്രോട്ടീൻ ഘടനാപരമായ പ്രോട്ടീനുകളായ VP1, VP2, VP3, VP4 എന്നിവയെ കോഡ് ചെയ്യുന്നു; P2, P3 കോഡ് 7 നോൺസ്ട്രക്ചറൽ പ്രോട്ടീനുകൾ (2A~2C, 3A~3D). ഈ 4 സ്ട്രക്ചറൽ പ്രോട്ടീനുകളിൽ, വൈറൽ കാപ്സിഡിന്റെ ഉൾവശത്ത് ഉൾച്ചേർത്തതും കോറുമായി അടുത്ത ബന്ധമുള്ളതുമായ VP4 ഒഴികെ, മറ്റ് 3 സ്ട്രക്ചറൽ പ്രോട്ടീനുകളെല്ലാം വൈറസ് കണങ്ങളുടെ ഉപരിതലത്തിൽ തുറന്നുകിടക്കുന്നു. അങ്ങനെ, ആന്റിജനിക് ഡിറ്റർമിനന്റുകൾ അടിസ്ഥാനപരമായി VP1~VP3 ലാണ് സ്ഥിതി ചെയ്യുന്നത്.