ადამიანის ენტეროვირუსი 71 (EV71) მიეკუთვნება ოჯახს Picornaviridae. გენომი არის ერთსაფეხურიანი პოზიტიური დაძაბული რნმ, რომლის სიგრძეა დაახლოებით 7400 ნუკლეოტიდი და მხოლოდ ერთი ღია კითხვის ჩარჩო. დაშიფრული პოლიპროტეინი შეიცავს დაახლოებით 2190 ამინომჟავას. ეს პოლიპროტეინი შეიძლება კიდევ უფრო ჰიდროლიზირებული იყოს P1, P2 და P3 წინამორბედის ცილებამდე. P1 წინამორბედის ცილის კოდები სტრუქტურული ცილები VP1, VP2, VP3 და VP4; P2 და P3 კოდი 7 არასტრუქტურული ცილები (2a ~ 2c და 3a ~ 3D). ამ 4 სტრუქტურულ ცილაში, გარდა VP4, რომელიც ჩანერგილია ვირუსული კაფსიდის შიდა მხარეს და მჭიდრო კავშირშია ბირთვთან, სხვა 3 სტრუქტურული ცილა ყველა ექვემდებარება ვირუსის ნაწილაკების ზედაპირზე. ამრიგად, ანტიგენური განმსაზღვრელი ფაქტორები ძირითადად განთავსებულია VP1 ~ VP3- ზე.