重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）は、2019年に発生した新型コロナウイルス感染症（COVID-19）パンデミックの原因病原体であり、ゲノムサイズが約30kbのプラス鎖一本鎖RNAウイルスです。パンデミック期間中、SARS-CoV-2には、それぞれ異なる変異シグネチャーを持つ多くの変異株が出現しました。スパイクタンパク質の変異状況によっては、一部の変異株は、より高い伝染性、感染力、および病原性を示しています。

2023年8月に初めて確認されたSARS-CoV-2のBA.2.86系統は、EG.5.1やHK.3を含む現在流行しているオミクロンXBB系統とは系統発生的に異なっている。BA.2.86系統はスパイクタンパク質に30以上の変異を有しており、この系統が既存の抗SARS-CoV-2免疫を回避する能力が非常に高いことを示している。

JN.1 (BA.2.86.1.1) は、BA.2.86 系統から派生した、最も最近出現した SARS-CoV-2 の変異株です。JN.1 は、スパイクタンパク質に特徴的な変異 L455S を持ち、非スパイクタンパク質に他の 3 つの変異を持っています。HK.3 や他の「FLip」変異株を調査した研究では、スパイクタンパク質の L455F 変異の獲得が、ウイルスの伝染性と免疫回避能力の増加に関連していることが示されています。L455F および F456L 変異は「フリップこれらの変異は、スパイクタンパク質上のFとLという2つのアミノ酸の位置を入れ替えるためである。

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