最近の新型コロナウイルス感染症（COVID-19）パンデミックの原因病原体である重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）は、ゲノムサイズが約30kbのプラス鎖一本鎖RNAウイルスです。パンデミックを通じて、明確な変異特性を持つ多くのSARS-CoV-2の変異体が出現しました。スパイクタンパク質の変異状況に応じて、一部の変異体はより高い伝染性、感染性、および毒性を示しています。

2023年8月に初めて特定されたSARS-CoV-2のBA.2.86系統は、現在流行しているEG.5.1やHK.3を含むオミクロンXBB系統とは系統学的に異なります。BA.2.86系統はスパイクタンパク質に30以上の変異を有しており、この系統は既存のSARS-CoV-2に対する免疫を回避する能力が高いことを示しています。

JN.1（BA.2.86.1.1）は、BA.2.86系統から派生した、最近出現したSARS-CoV-2の変異体です。JN.1は、スパイクタンパク質に特徴的な変異L455Sと、非スパイクタンパク質に3つの変異を有しています。HK.3やその他の「FLip」変異体を調査した研究では、スパイクタンパク質のL455F変異の獲得が、ウイルスの伝染性および免疫回避能力の増加と関連していることが示されています。L455FおよびF456L変異は、「フリップ突然変異は、スパイクタンパク質上の F と L と呼ばれる 2 つのアミノ酸の位置を入れ替えるため、突然変異と呼ばれます。

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