Raske äge hingamisteede sündroom koronaviirus 2 (SARS-COV-2), mis on viimase koronaviiruse haiguse 2019 (COVID-19) pandeemia põhjuslik patogeen, on positiivse servaga, üheahelaline RNA-viirus, mille genoomi suurus on umbes 30 kB umbes 30 kb . Many variants of SARS-CoV-2 with distinct mutational signatures have emerged throughout the pandemic. Depending on their spike protein mutational landscape, some variants have shown higher transmissibility, infectivity, and virulence.

Esmakordselt 2023. aasta augustis tuvastatud SARS-COV-2 BA.2.86 sugupuu eristub fülogeneetiliselt praegu ringlevast Omicron XBB liinidest, sealhulgas nt.5.1 ja HK.3. BA.2.86 sugupuu sisaldab rohkem kui 30 mutatsiooni Spike valgus, mis näitab, et see sugupuu on suuresti võimeline vältima eelnevat olemasolevat SARS-COV-2 immuunsust.

The JN.1 (BA.2.86.1.1) is the most recently emerged variant of SARS-CoV-2 that descended from the BA.2.86 lineage. The JN.1 contains a hallmark mutation L455S in the spike protein and three other mutations in the non-spike proteins. HK.3 ja muude “FLIP” variantide uurimise uuringud on näidanud, et L455F mutatsiooni omandamine teravikuvalgus on seotud suurenenud viiruse ülekandetavuse ja immuunsuse vältimise võimega. The L455F and F456L mutations are nicknamed ”