El coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo grave (SARS-CoV-2), agente patógeno causante de la pandemia más reciente de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19), es un virus de ARN monocatenario de sentido positivo con un genoma de aproximadamente 30 kb. A lo largo de la pandemia, han surgido numerosas variantes del SARS-CoV-2 con firmas mutacionales distintas. Dependiendo del perfil mutacional de su proteína de espícula, algunas variantes han mostrado mayor transmisibilidad, infectividad y virulencia.

El linaje BA.2.86 del SARS-CoV-2, identificado por primera vez en agosto de 2023, es filogenéticamente distinto de los linajes Omicron XBB que circulan actualmente, incluidos EG.5.1 y HK.3. El linaje BA.2.86 contiene más de 30 mutaciones en la proteína de la espícula, lo que indica que este linaje es altamente capaz de evadir la inmunidad preexistente contra el SARS-CoV-2.

El JN.1 (BA.2.86.1.1) es la variante más reciente del SARS-CoV-2 que desciende del linaje BA.2.86. El JN.1 contiene una mutación característica L455S en la proteína de la espícula y otras tres mutaciones en las proteínas que no son de la espícula. Los estudios que investigan el HK.3 y otras variantes "FLip" han demostrado que adquirir la mutación L455F en la proteína de la espícula está asociado con una mayor transmisibilidad viral y capacidad de evasión inmunitaria. Las mutaciones L455F y F456L se denominan "Voltear"Las mutaciones se producen porque intercambian las posiciones de dos aminoácidos, denominados F y L, en la proteína de la espícula.

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