Síndrome respiratorio agudo severo Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), el patógeno causal de la pandemia más reciente de la enfermedad de coronavirus 2019 (Covid-19), es un virus de ARN de una sola cadena de sentido positivo con un tamaño de genoma de alrededor de 30 kb de alrededor de 30 kb . Muchas variantes de SARS-CoV-2 con firmas mutacionales distintas han surgido en toda la pandemia. Dependiendo de su paisaje mutacional de proteína espiga, algunas variantes han mostrado una mayor transmisibilidad, infectividad y virulencia.

El linaje BA.2.86 de SARS-CoV-2, que se identificó por primera vez en agosto de 2023, es filogenéticamente distinto de los linajes Omicron XBB que circulan actualmente, incluidos Eg.5.1 y HK.3. El linaje BA.2.86 contiene más de 30 mutaciones en la proteína de espiga, lo que indica que este linaje es altamente capaz de evadir la inmunidad anti-Sars-CoV-2 preexistente.

El JN.1 (BA.2.86.1.1) es la variante emergente más recientemente de SARS-CoV-2 que descendió del linaje BA.2.86. El JN.1 contiene una mutación distintiva L455S en la proteína de espiga y otras tres mutaciones en las proteínas no pico. Los estudios que investigan HK.3 y otras variantes de "Flip" han demostrado que la adquisición de la mutación L455F en la proteína de espiga se asocia con una mayor transmisibilidad viral y capacidad de evasión inmune. Las mutaciones L455F y F456L son apodadas "Voltear"Mutaciones porque cambian las posiciones de dos aminoácidos, marcados F y L, en la proteína de espiga.

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