Das schwere akute respiratorische Syndrom Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), der Erreger der jüngsten Coronavirus-Krankheit 2019 (COVID-19), ist ein einzelsträngiges RNA-Virus mit positiver Polarität und einer Genomgröße von etwa 30 kb. Im Verlauf der Pandemie traten zahlreiche Varianten von SARS-CoV-2 mit unterschiedlichen Mutationsmustern auf. Abhängig von ihrem Mutationsprofil im Spike-Protein zeigten einige Varianten eine höhere Übertragbarkeit, Infektiosität und Virulenz.

Die im August 2023 erstmals identifizierte BA.2.86-Linie von SARS-CoV-2 unterscheidet sich phylogenetisch von den derzeit zirkulierenden Omicron-XBB-Linien, einschließlich EG.5.1 und HK.3. Die BA.2.86-Linie weist mehr als 30 Mutationen im Spike-Protein auf, was darauf hindeutet, dass diese Linie in hohem Maße in der Lage ist, die bereits bestehende Immunität gegen SARS-CoV-2 zu umgehen.

JN.1 (BA.2.86.1.1) ist die jüngste Variante von SARS-CoV-2 und stammt von der BA.2.86-Linie ab. JN.1 weist die charakteristische Mutation L455S im Spike-Protein sowie drei weitere Mutationen in den Nicht-Spike-Proteinen auf. Studien zu HK.3 und anderen „FLip“-Varianten haben gezeigt, dass der Erwerb der Mutation L455F im Spike-Protein mit einer erhöhten viralen Übertragbarkeit und Immunfluchtfähigkeit einhergeht. Die Mutationen L455F und F456L werden als „FLip-Mutationen“ bezeichnet.„Umdrehen“Mutationen, weil sie die Positionen zweier Aminosäuren, bezeichnet mit F und L, auf dem Spike-Protein vertauschen.

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