Human Enterovirus 71 (EV71) gehört zur Familie Picornaviridae. Das Genom ist eine einsträngige positive RNA mit einer Länge von etwa 7400 Nukleotiden und nur einem offenen Leserahmen. Das codierte Polyprotein enthält etwa 2190 Aminosäuren. Dieses Polyprotein kann weiter zu P1-, P2- und P3 -Vorläuferproteinen hydrolysiert werden. P1 -Vorläuferprotein codiert Strukturproteine ​​VP1, VP2, VP3 und VP4; P2- und P3 -Code 7 nichtstrukturelle Proteine ​​(2a ~ 2c und 3a ~ 3d). In diesen 4 Strukturproteinen, mit Ausnahme von VP4, die in die innere Seite des Viruskapsids eingebettet und eng mit Kern verbunden sind, werden andere 3 Strukturproteine ​​auf der Oberfläche von Viruspartikeln ausgesetzt. Somit befinden sich antigene Determinanten im Grunde genommen auf VP1 ~ VP3.