L'Helicobacter pylori és un bacteri gramnegatiu, i la forma en espiral li dóna el nom d'helicobacterpylori. L'Helicobacter pylori viu en diferents zones de l'estómac i el duodè, cosa que provoca una inflamació crònica lleu de la mucosa gàstrica, úlceres gàstriques i duodenals i càncer gàstric. L'Agència Internacional per a la Recerca del Càncer va identificar la infecció per HP com a carcinogen de classe I el 1994, i l'HP cancerígena conté principalment dues citotoxines: una és la proteïna CagA associada a la citotoxina, l'altra és la citotoxina vacuolant (VacA). L'HP es pot dividir en dos tipus segons l'expressió de CagA i VacA: el tipus I és una soca toxigènica (amb expressió tant de CagA com de VacA o de qualsevol d'elles), que és altament patogènica i fàcil de causar malalties gàstriques; el tipus II és HP atoxigènica (sense expressió tant de CagA com de VacA), que és menys tòxica i normalment no presenta símptomes clínics després de la infecció.