হিউম্যান এন্টারোভাইরাস 71 (ইভি 71) পিকার্নাভিরিডে পরিবারের অন্তর্ভুক্ত। জিনোম একটি একক-স্ট্র্যান্ডেড পজিটিভ স্ট্র্যান্ডড আরএনএ যা প্রায় 7400 নিউক্লিওটাইডগুলির দৈর্ঘ্য এবং কেবল একটি খোলা রিডিং ফ্রেম। এনকোডেড পলিপ্রোটিনে প্রায় 2190 অ্যামিনো অ্যাসিড রয়েছে। এই পলিপ্রোটিনটি আরও পি 1, পি 2 এবং পি 3 পূর্ববর্তী প্রোটিনগুলিতে হাইড্রোলাইজড হতে পারে। পি 1 পূর্ববর্তী প্রোটিন কোডগুলি স্ট্রাকচারাল প্রোটিন ভিপি 1, ভিপি 2, ভিপি 3 এবং ভিপি 4; পি 2 এবং পি 3 কোড 7 ননস্ট্রাকচারাল প্রোটিন (2 এ ~ 2 সি এবং 3 এ ~ 3 ডি)। এই 4 টি স্ট্রাকচারাল প্রোটিনগুলিতে, ভিপি 4 ব্যতীত যা ভাইরাল ক্যাপসিডের অভ্যন্তরীণ দিকে এম্বেড করা আছে এবং কোরের সাথে ঘনিষ্ঠভাবে সংযুক্ত রয়েছে, অন্যান্য 3 স্ট্রাকচারাল প্রোটিনগুলি সমস্ত ভাইরাস কণার পৃষ্ঠে প্রকাশিত হয়। সুতরাং, অ্যান্টিজেনিক নির্ধারকগুলি মূলত ভিপি 1 ~ ভিপি 3 এ অবস্থিত।